Le lieutenant-major et commandant des troupes du roi, Charles de Saint-Étienne de La Tour, invite Philippe Mius d’Entremont à l’accompagner en Acadie lors du voyage qu’il effectue en 1651. Il le nomme major-général et lui remet la baronnie de Pobomcoup (Pubnico, N.-É.) en 1653. En plus d’être la seule baronnie en Acadie, elle est héréditaire.

Pendant l’occupation anglaise qui dure jusqu’en 1667, peu d’informations sont disponibles au sujet du sieur d’Entremont. En 1670 toutefois, il est nommé procureur du roi de France en Acadie, fonction qu’il exerce pendant 18 ans. Le recensement de 1671 permet aussi de constater qu’il réside à Pobomcoup avec son épouse Madeleine Hélie, quatre enfants et qu’il possède six arpents de terre, 26 bêtes à cornes, 29 brebis, 12 chèvres et 20 cochons.

Puisque ses fonctions exigent qu’il accompagne le gouverneur lors de ses déplacements, lui et sa famille doivent déménager à plusieurs reprises dans les années qui suivent : à Port-Royal en 1678, à Beaubassin l’année suivante (sous la gouverne de La Vallière) et à Port-Royal en 1684 (alors que Perrot est nommé gouverneur). Pendant toutes ces années, son fils aîné Jacques s’occupe de ses établissements à Pubnico. Finalement, en 1687, Philippe Mius d’Entremont se retire alors qu’il est âgé de 86 ans. Il s’installe à Grand-Pré où il réside jusqu’à sa mort en 1700.